En la Copa y la Copa de Liga fue eliminado, en ambos torneos, en la ronda de cuartos de final, a manos del modesto Évian Thonon y AS Saint-Étienne. Los años 1960 también fueron importantes para el FC Lyn, consiguiendo dos títulos de liga y dos de copa. Deportivamente, en esa temporada se enfrentó al Alicante en el campo de la Florida, camiseta barcelona desplazando todo un ejército granota de 60 autobuses para apoyar al equipo en su ascenso.
